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文學院
中國文學系碩士班
外國語文學系碩士班（
甲組
、
乙組
）
哲學研究所碩士班
劇場藝術學系碩士班
藝術管理與創業研究所碩士班
音樂學系碩士班
理學院
生物科學系碩士班（
甲組
、
乙組
）
化學系碩士班
物理學系碩士班
應用數學系碩士班（
甲組
、
乙組
、
丙組
、
丁組
）
工學院
電機工程學系碩士班
（
甲組
、
乙組
、
丙組
、
丁組
、
戊組
、
己組
、
庚組
）
環境工程研究所碩士班
資訊工程學系碩士班（
甲組
、
乙組
）
光電工程學系碩士班
通訊工程研究所碩士班
（
甲組
、
乙組
）
機械與機電工程學系碩士班
（
甲組
、
乙組
、
丙組
、
丁組
、
戊組
）
材料與光電科學學系碩士班
積體電路設計研究所碩士班
資訊工程學系資訊安全碩士班
材料與光電科學學系前瞻應用材料碩士班
（
甲組
、
乙組
）
管理學院
企業管理學系企業管理碩士班甲班
資訊管理學系碩士班
財務管理學系碩士班
公共事務管理研究所碩士班
人力資源管理研究所碩士班
行銷傳播管理研究所碩士班
（
甲組
、
乙組
）
企業管理學系企業管理碩士班乙班
企業管理學系醫務管理碩士班
國際經營管理碩士學程
人力資源管理全英語碩士學位學程
海洋科學學院
海洋生物科技暨資源學系碩士班
海下科技研究所碩士班
海洋環境及工程學系離岸風電海事工程碩士班
海洋生態與保育研究所碩士班
海洋事務研究所碩士班
海洋科學系碩士班（
甲組
、
乙組
）
海洋環境及工程學系碩士班
（
甲組
、
乙組
）
社會科學院
中國與亞太區域研究所碩士班
（
甲組
、
乙組
、
丙組
）
政治學研究所碩士班
經濟學研究所碩士班
教育研究所碩士班（
甲組
、
乙組
）
社會學系碩士班
西灣學院
社會創新研究所碩士班
醫學院
精準醫學研究所碩士班
生技醫藥研究所碩士班
生物醫學研究所碩士班
醫學科技研究所碩士班
（
甲組
、
乙組
）
半導體及重點科技研究學院
先進半導體封測研究所碩士班
精密電子零組件研究所碩士班
創新半導體製造研究所碩士班
國際金融研究學院
數位與永續金融研究所
國際資產管理研究所